苦瓜嫁接后植株生长势强，生长健壮，耐湿能力增加，对温度的适应能力增强，采收期长，产量高，瓜大，品质好。通过选择适宜的砧木，嫁接可起到抗蔓枯病、疫病的作用，对根瘤线虫也有一定的耐性。苦瓜嫁接中的一些管理措施基本与其他瓜类嫁接的相同，可进行参考;嫁接的栽培管理参考上述栽培技术(但接口不能与土壤接触)。苦瓜的嫁接方法有很多，下面仅介绍几种生产中较易进行的方法供参考。
1.砧木的选择：苦瓜嫁接的砧木一般宜选择丝瓜，尤以选择生长势旺盛的长丝瓜为好。2.嫁接的方法：(1)靠接法：选择饱满、无病的南瓜(或丝瓜)、苦瓜种子，经种子消毒、浸种和催芽后，一起播种在10厘米×10厘米×8厘米的塑料营养钵中，在26℃下经10天左右就可嫁接。此时幼苗已长出1片真叶，第二片真叶还未展开。在砧木和接穗相面对的下胚轴上，于子叶下1.5厘米处，用很锋利的刀轻削深约幼茎三分之一或四分之一、长1厘米左右的切口，然后将砧木和接穗的切口靠在一起，用嫁接夹夹好即可，嫁接后进行保温、保湿和遮荫。经靠接10天后接口已基本愈合，即可开始切断接穗的根。嫁接后25天或30天的幼苗可进行定植。(2)舌状靠接：经浸种、催芽，播种后的苦瓜、丝瓜苗约10天后(1片真叶展开，第二片真叶未展开时)即可进行舌状靠接。嫁接时将苦瓜和丝瓜苗从苗床上起出(要少伤根)，选择大小和苗高相同的幼苗，在苦瓜苗子叶下1.5厘米外的下胚轴处。刀口向上斜切，斜深半厘米左右，呈舌状切口;在丝瓜下胚轴上于相应的位置也切一舌状切口，但切口向下，深也为半厘米左右。然后将苦瓜与丝瓜的切口相嵌合，用嫁接夹夹好切口嵌合处，再将苦瓜和丝瓜的嫁接苗合栽于育苗钵或育苗床中。这种方法嫁接的成活率高，已被大多数生产者所采用。(3)顶劈嫁接：丝瓜比苦瓜早播5-7天。当丝瓜长到真叶3片时进行.除去丝瓜生长点和2片真叶，留1片真叶，在丝瓜幼茎顶端对准两子叶中间，向下直切深1厘米左右的切口，不能完全劈成两半，只劈开幼茎的半边。苦瓜苗去除根，在子叶下半厘米处向下切成楔形，切口长1厘米左右或略短于丝瓜的切口。将切好的苦瓜接穗插入丝瓜切口中用嫁接夹夹住即可。也可在丝瓜砧木长出1片真叶时进行，除去丝瓜的生长点和真叶，只留2片子叶，在2片子叶中间切开下胚轴半边，切口长1厘米左右。苦瓜接穗同上切成楔形，然后插入丝瓜切口中，用嫁接夹夹好。顶劈嫁接法较好操作，但成活率不如靠接法。(4)顶劈靠接：此法与顶劈嫁接法相似，只是砧木不留真叶，只留l片子叶，在两子叶间切口。苦瓜不断根，只是在子叶节下1厘米处向上斜切呈舌状，使苦瓜的舌状切口插入丝瓜切口中，并将切口夹好，苦瓜斜种于丝瓜旁。
此技术可以有效控制土传病害(枯萎病、青枯病等)，生长势一致，采收期延长，苦瓜产量提高，同时解决了苦瓜连作问题。