竹鼠洞深而且多有分支，洞道向上方和左右弯曲，藏于竹蔸深处，单独挖穴或往洞中灌水，很难将竹鼠驱出洞来。由于竹鼠没有喝水的习性，如强行灌水，会迫使竹鼠喝饱水后才跑出来，这时即使捉住也难以养活。
最有效的方法是先扒开洞口的松土，在洞口堆上干草，点燃后添加生草和鲜树叶，并向火里投放几个辣椒，燃烧时冒出大量呛鼻的黑烟，然后将黑烟煽进洞内，2~3 分钟后竹鼠抵不住呛鼻的黑烟，便跑出洞外。要注意的是成年野生竹鼠被烟熏刺激后冲出洞口时十分凶猛，见人就咬，如不注意捕捉方法很容易被它咬伤。
当竹鼠冲出洞口时，不能用木棍敲打或按压，应该利用麻袋或编织袋套捉并放进铁笼，采用一窝一笼的方式将它们装运回家驯养。